在不远的未来，“梦边缘”公司提供梦境编辑服务，专治创伤和噩梦。重度失眠症患者浅尾接受手术，删除了纠缠他十年的噩梦——一个永远追不上他的黑影。术后他感到前所未有的轻松，但怪事随之而来：他开始忘记现实中的日常，例如同事的名字、回家的路。更诡异的是，每一个消失的记忆，都会在第二天成为报纸上某起悬案被害者的遗物。浅尾发现，“梦边缘”并非删除噩梦，而是将噩梦转嫁给现实中活生生的“容器”。而他的那个黑影噩梦，已经被转嫁给了最后一个容器——一个无辜的小女孩。为了救女孩并找回记忆，他必须再次进入已被删除的梦境最深处。
今敏式的虚实交错感在这部动画电影中得到了完美继承。画风诡谲华丽，梦境中的视觉奇观令人目不暇接。剧本对记忆与身份的关系进行了哲学层面的探讨，结尾三分钟的蒙太奇足以载入动画史册。
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